蒙医药学科是内蒙古民族大学具有优势、特色学科。创建于 1978 年， 学科创始人苏荣扎布教授是学术界公认的当代中国蒙医学学科的主要创建者之一。在苏荣扎布 教授的带领下， 经过几代人的不懈努力，蒙医药学科有了坚实的基础。蒙医学于1985年蒙医学被自治区教育厅确定为自治区重点扶持专业， 1987年被确定为自治区重点学科 ，同年蒙医学专业被列入国家高等教育本科专业目录。 蒙药学于 2004 年被国家中医药管理局确认为重点学科。

　　2000 年合校以来，蒙医药学科在民族大学 “ 突出办好蒙医专业 ” 的有利条件下，依托综合性大学资源平台，从保持和提升 “ 蒙医、蒙药 ” 在自治区的领先地位，努力打造教学水平、科研水平、服务水平 “ 三个一流 ” 的目标出发 , 适应新世纪经济与社会发展对人才培养要求；遵循 “ 继承与发扬并重，教学与科研并举 ” 治学理念，有重点分阶段地推进学科建设，取得了喜人的成就。

　　目前已有国家民委－教育部共建重点实验室 1 个；自治区品牌专业 1 个，自治区示范课程 1 个，自治区精品课程 3 个，自治区级实验教学示范中心 1 个，自治区合格实验室 5 个；学校重点学科 2 个，校级精品课程 3 个，校级优秀课程 8 个。

　　目前已有蒙医学、药物制剂（蒙授）、护理学（蒙授）、蒙药学四个本科专业，蒙药学（一级学科）、民族医学、蒙西医结合基础、蒙西医结合临床等 4 个硕士学位授予点。

　　目前师资队伍有 89 人，其中博士学位8名，硕士学位 17 名，教授 28 名，副教授 34 人，讲师 21人，高级实验师 5 人。享受政府特殊津贴专家 2 名，自治区有突出贡献的中青年专家3名，自治区 “111”人才工程第二层次入选者 1名；和 “321” 人才工程第一层和第二层次入选者 3名；

　　近三年内发表论文 223余 篇，承担了科研项目 42项，其教育部、国家中医药管理局课题 5 项，自治区教育厅、卫生厅、科技厅、自然科学基金项目等 19 项。在药物研究方面获国家专利证书 1 项，获国家三类新蒙药证书 1 项，获准临床研究 2 项，获自治区科技进步二等奖 2 项，二、三等奖 3 项。

　　在近 30 年的教学实践中 , 蒙医药学科积累了丰富的教学经验，师资力量得到壮大和培养 , 以优质的教学水平为内蒙古自治区和少数民族八省区培养了大批的蒙医药高等人才 , 历届毕业生遍布全国各地。这些毕业生以良好的人文素质、高水平的专业技能和兢兢业业的敬业精神 , 得到了社会的普遍赞誉和欢迎 , 成为自治区医药卫生事业和教学、科研以及生产领域的一支骨干力量。

　　2007 年我蒙医药学院被评为自治区教育系统先进集体。