蒙医药学科是内蒙古民族大学具有优势学科、特色学科。蒙医药学院是内蒙古民族大学的特色学院之一，是在1978年创建的原内蒙古蒙医学院的主体部分蒙医学系和蒙药系的基础上，于2000年合并组建的二级学院。

　　学院经过两三代人的不懈努力，蒙医药高等教育事业有了坚实的基础。合校后，学院在自治区开发蒙医药的大好时机和民族大学“突出办好蒙医专业”的有利条件下，从保持和提升“蒙医、蒙药”在自治区的领先地位，努力打造教学水平、科研水平、服务水平 “三个一流”的目标出发,适应新世纪经济与社会发展对人才培养要求；遵循“继承与发扬并重，教学与科研并举”治学理念，有重点分阶段地推进学科建设，各项事业有了长足的发展。

　　学院努力提高教学质量，重视课程建设、实验室建设、专业建设和研究生教育，现有国家中医药管理局重点学科1个，国家民委－教育部共建重点实验室1个；自治区重点学科1个，自治区品牌专业1个，自治区示范课程1个，自治区精品课程3个，自治区级实验教学示范中心1个，自治区合格实验室5个；学校重点学科2个，校级精品课程3个，校级优秀课程8个。学院现有蒙药学（一级学科）、民族医学、蒙西医结合基础、蒙西医结合临床等4个硕士学位授予点和蒙医学、药物制剂、护理学（蒙授）、蒙药学四个本科专业，蒙医骨伤学、蒙药学等2个专科专业。

　　学校努力提高教学质量，重视实施名师、名课、名专业、精品教材、优秀教改立项和优秀教学成果等"名品工程"建设，现有一门国家级精品课程，省级精品课程门数、省级优秀教学成果奖数量居校内前列。

　　学院重视师资队伍建设和人才培养，现有教职工83人，其中教授15名，副教授29人，讲师16人，高级实验师5人。享受政府特殊津贴专家2名，自治区有突出贡献的中青年专家4名，自治区“111”和“321”人才工程第一层和第二层人员5名；现有全日制在校学生852人。硕士生68人。

　　学院设有7个教研室、6个实验室（其中自治区高校“双基”合格实验室5个），1个蒙医史陈列室，1个蒙药标本馆、26个实践教学基地。

　　学院与黑龙江中医药大学、沈阳药科大学、吉林农业大学、内蒙古奥特其蒙药股份有限公司等高校和企业建立了良好的协作关系。是国家执业药师培训基地。在药物研究方面获国家专利证书1项，获国家三类新蒙药证书1项，获准临床研究2项，获自治区科技进步二等奖1项，二、三等奖3项。合校以来，学院共承担了科研项目44项，其教育部、国家中医药管理局课题5项，自治区教育厅、卫生厅、科技厅、自然科学基金项目等19项。

　　学院学生政治思想教育和管理工作取得了可喜的成绩。96级蒙医本科班于1999年被教育部、共青团中央评为全国先进班集体、98级蒙医本科班于2001年被教育部、共青团评为全国先进班集体标兵、学生工作办公室于2001年被自治区教育厅和团委评为全区高校学生工作先进集体。具有思想性、教育性、知识性、民族性、创新性校园文化活动，为学生的健康成长和发展成才创造了良好的环境，在全区“挑战杯”大学生科技学术作品竞赛、青年志愿者活动、文艺汇演及各种评优表彰中多次获奖、学生中呈现出团结、进步、创新的良好局面。

　　跨入新世纪，蒙医药学院制定了实现新一轮跨越式发展目标，始终不渝地坚持以内涵发展为主的战略，始终不渝地坚持以质量求发展的办学思想，为建设好内蒙古民族大学，不断作出新贡献。