蒙医药学院本科生教育是从1978年开始的，当时只有蒙医学专业，1979年招收第一个本科班级。于1984年毕业，共29名学生。2000年增设药物制剂（蒙授）专业，2001年春季招收第一届药物制剂（蒙授）专业本科生，于2004年毕业，共43名学生。2002年增设护理学（蒙授）专业，2003年招收第一届护理学（蒙授）专业本科生，2008年毕业，共49名学生。2007年招收第一届蒙药学专业本科生。

　　目前具有4个本科生专业。每年招收200余名学生。蒙医学专业于2005年被评为自治区首批品牌专业。蒙医学、药物制剂（蒙授）专业于2007年晋升为本科第一批录取专业。

　　学院以本科教育教学为中心，加强师资队伍建设、教材建设和实践教学建设，强化常规管理，坚持教学改革，优化教学环境，不断提高教学质量，努力为自治区经济建设和社会发展培养出合格的蒙医药学人才！